BKUS Precīzijas medicīnas centrs pediatrijā (PMPC) ir progresīva pētniecības un veselības aprūpes iniciatīva, kuras mērķis ir pārveidot pediatrijas medicīnu, izmantojot precīzu diagnostiku, mērķtiecīgu terapiju un progresīvus pētījumus. PMPC dibināts Bērnu klīniskās universitātes slimnīcā Rīgā, un tas sadarbojas ar vadošajām Eiropas institūcijām, tostarp Princess Máxima centru lielāko bērnu onkoloģijas centru Eiropā. Ar programmas Horizon Europe WIDERA atbalstu PMPC veido pētniecības infrastruktūru, tostarp biobanku, genomikas un datu analīzes vienību un klīnisko pētījumu centru. PMPC misija ir uzlabot izpratni par sarežģītām bērnu slimībām, uzlabot ārstēšanas rezultātus un veicināt starptautisku zināšanu apmaiņu.

***

Meklējam jaunu kolēģi Bioinformātikas speciālistu projektā

Arvien straujāk attīstoties personalizētai un precīzijas medicīnai, kā arī iesaistoties starptautiskos pētniecības un inovāciju projektos, Bērnu klīniskajā universitātes slimnīcā (BKUS) tiek attīstīta precīzijas medicīna onkoloģijā. BKUS misija ir ārstēt, aprūpēt, mācīt un iedvesmot tā, lai bērniem Latvijā būtu iespējami veselīgāka un pilnvērtīgāka dzīve. Šīs misijas realizēšana ir atkarīga no cilvēkiem, kas strādā pie mums, tādēļ apzināmies, ka motivēti un iesaistīti darbinieki ir BKUS nozīmīgākā vērtība.

Nāc, pievienojies un esi viens no mums!

• Bakalaura vai maģistra grāds bioinformātikā, biostatistikā, (skaitļošanas) bioloģijā, datu zinātnē vai citā līdzvērtīgā nozarē ar praktisku pieredzi bioinformātikā;

• Nepieciešamas teicamas tehniskās un programmēšanas prasmes, vēlams Bash, R, Python un Java;

• Vēlamas zināšanas par darbplūsmas pārvaldības sistēmām, t.sk. WDL, Nextflow vai Snakemake, un konteinerizāciju (Docker);

• Vēlamas zināšanas nākamās paaudzes sekvencēšanas (NGS) tehnoloģijās, molekulārajā bioloģijā un ģenētikā, statistikā un iepriekšēja pieredze darbā ar Linux OS, augstas veiktspējas skaitļošanas sistēmām un/vai mākoņserveru platformām;

• Iepriekšēja pieredze darbā ar NGS datu bioinformātisko analīzi, t.sk. sadarbspējīgu rīku un darbplūsmu izveidi, uzturēšanu, optimizāciju un automatizāciju;

• Vēlama pieredze programmatūras dzīves ciklā (angl. software lifecycle);

• Augsta atbildības sajūta, labas analītiskās spējas, precīza pieeja dokumentācijai un kvalitātes kontrolei;

• Labas komunikācijas prasmes darbam multidisciplinārā komandā;

• Teicamas latviešu un labas angļu valodas zināšanas (lai nodrošinātu zināšanu pārnesi un komunikāciju ar sadarbības partneriem ārvalstīs);

• Atbilstība Bērnu tiesību aizsardzības likuma 72. panta prasībām;

• Priekšroka tiks dota kandidātiem, kam ir praktiska pieredze darbā ar (Nanopore) garo nolasījumu (angl. long-reads) sekvencēšanas tehnoloģijas datiem.

• Īstenot pētniecības un inovācijas projektus onkoloģijas jomā, lai uzlabotu molekulāro diagnostiku;

• Veikt pētniecības un diagnostiskās inovācijas darbu, ievērojot pētniecības un profesionālās ētikas principus, nodrošinot augstākos kvalitātes un integritātes standartus;

• Piedalīties augstas veiktspējas skaitļošanas infrastruktūras izveidē, lai ieviestu efektīvu platformu datu uzglabāšanai un analīzei;

• Izstrādāt un ieviest (Nanopore) garo nolasījumu sekvencēšanas datu analīzes darbplūsmu metilācijas un ģenētisko variantu noteikšanai;

• Piedalīties datu analīzes darbplūsmas izveidē, izmantojot dažādas darbplūsmu pārvaldības sistēmas, t.sk. Nextflow vai WDL/Cromwel, nodrošinot savietojamību starp lokālo augstas veiktspējas skaitļošanas infrastruktūru un mākoņvidi;

• Nodrošināt (Nanopore) garo nolasījumu sekvencēšanas datu analīzes procesa automatizāciju un atbilstību vispārpieņemtiem FAIR principiem (angl. Findability, Accessibility, Interoperability, Reusability);

• Veikt izstrādāto darbplūsmu ieviešanu diagnostikā, kā arī validācijas plāna un protokolu sagatavošanu un kvalitātes kontroles kritēriju izstrādi;

• Ieviest darbības, kas nepieciešamas, lai sasniegtu projektā plānotos rezultātus un šo procesu nepārtrauktu uzlabošanu;

• Piedalīties zinātnisko publikāciju sagatavošanā;

• Sadarboties ar citām slimnīcām, pētniecības institūcijām un universitātēm valsts un starptautiskā līmenī.

• Unikālu pieredzi vienīgajā Bērnu slimnīcā Latvijā;

• Atbildīgu, dinamisku un interesantu darbu;

• Aizrautīgus kolēģus, kam rūp BKUS attīstība un uz vērtībām orientētu darba vidi;

• Iespēju piedalīties inovatīvu metožu izstrādē, lai uzlabotu pediatrisku onkoloģijas pacientu ātru un efektīvu molekulāro diagnostiku;

• Iespēju strādāt kopā ar pieredzējušiem bioinformātikas speciālistiem no ārvalstu sadarbības institūcijām un gūt pieredzi darbā ar (Nanopore) garo nolasījumu sekvencēšanas tehnoloģiju;

• Stabilu atalgojumu un sociālās garantijas, t.sk. veselības apdrošināšanu pēc pārbaudes laika beigām;

• Atalgojums līdz 3500.00 EUR mēnesī pirms nodokļu nomaksas;

• Attālināta darba iespējas pēc vienošanās;

• Iespēju mācīties un tālākas izaugsmes iespējas, t.sk. pieredzes apmaiņas vizītes, mācības sadarbības slimnīcās un institūcijās;

• Bezmaksas autostāvvietu.

Darba laiks: pilns darba laiks. 

Darba līgums: uz noteiktu laiku (uz vienu gadu ar iespēju pagarināt līgumu).

CV un motivācijas vēstuli ar norādi Pieteikums vakancei bioinformātikas speciālists projektā lūdzam sūtīt uz e-pastu: vakances@bkus.lv līdz 2025. gada 31.maijam.

Informējam, ka sazināsimies ar tiem kandidātiem, kuri tiks izvirzīti uz atlases 2.kārtu.

PMPC projektu finansē Eiropas Savienība. Tomēr izteiktie uzskati un viedokļi ir tikai autora(-u) un ne vienmēr atspoguļo Eiropas Savienības vai Eiropas Pētniecības izpildaģentūras viedokli. Ne Eiropas Savienība, ne atbalsta piešķīrēja iestāde nevar būt atbildīga par tiem.

Pamatojoties uz Eiropas Parlamenta un Padomes regulas(ES) 2016/679 par fizisko personu aizsardzību attiecībā uz personas datu apstrādi un šādu datu brīvu apriti un ar ko atceļ Direktīvu 95/46 EK (Vispārīgā datu aizsardzības regula, turpmāk VDAR) 13.pantu,VSIA Bērnu klīniskā universitātes slimnīcas informē, ka:

1) Jūsu pieteikuma dokumentos norādītie personas dati tiks apstrādāti, lai nodrošinātu šīs atlases konkursa norisi;

2) iepriekš minētās Jūsu personas datu apstrādes pārzinis ir VSIA Bērnu klīniskā universitātes slimnīca, kontaktinformācija: Vienības gatve 45, Rīga, LV-1004; elektroniskā pasta adrese: info@bkus.lv. Papildu VDAR 13.pantā minēto informāciju Jūs varat iegūt VSIA Bērnu klīniskā universitātes slimnīca interneta vietnē www.bkus.lvsadaļā Datu drošība.